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1.
Rev. argent. microbiol ; 55(3): 3-3, Oct. 2023.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1529618

RESUMO

Abstract The rocketing number of COVID-19 cases highlighted the critical role that diagnostic tests play in medical and public health decision-making to contain and mitigate the SARS-CoV-2 pandemic. This study reports the evaluation and implementation of different tests for the molecular detection of SARS-CoV-2 in the central region of Argentina. We evaluated 3 real time RT-PCR kits (GeneFinder COVID-19 Plus RealAmp Kit, DisCoVery SARS-CoV-2 RT-PCR Detection Kit and WGene SARS-CoV-2 RT Detection), 2 nucleic acid extraction methods [MagaBio plus Virus DNA/RNA Purification Kit II (BioFlux), 35-min vs. 9-min, a pre-analytical reagent (FlashPrep®) and 2 isothermal amplification tests (Neokit Plus and ELA CHEMSTRIP®). The order according to the best performance of the 3 real-time RT-PCR kits evaluated was: DisCoVery > GeneFinderTM> WGene. The 2 RNA extraction methods showed similar good results: MagaBio plus Virus RNA Purification Kit II (BioFlux) 9-min was selected due to its faster performance. FlashPrep® reagent showed excellent results to perform direct RNA detection. Isothermal amplification assays showed acceptable sensitivity and specificity values (>80%), except in samples with Ct> 30. Our data show optimal real time RT-PCR kits and alternative molecular methods for SARS-CoV-2 diagnostic. These alternative assays proved to be aceptable.


Resumen La explosión de casos de COVID-19 resaltó el papel fundamental que desempeñan las pruebas de diagnóstico en la toma de decisiones médicas y de salud pública para contener y mitigar la pandemia de SARS-CoV-2. Este estudio reporta la evaluación y la implementación de diferentes test para la detección molecular de SARS-CoV-2 en la región central de Argentina. Evaluamos tres kits de RT-PCR en tiempo real (GeneFinder COVID-19 Plus RealAmp Kit, DisCoVery SARS-CoV-2 RT-PCR Detection Kit y WGene SARS-CoV-2 RT Detection), dos métodos de extracción de ácidos nucleicos (MagaBio plus Virus DNA/RNA Purification Kit II [BioFlux, 35-min vs. 9-min), un reactivo pre-analítico (FlashPrep®) y dos test de amplificación isotérmica (Neokit Plus and ELA CHEMSTRIP®). El orden de rendimiento de los tres kits de RT-PCR en tiempo real evaluados fue el siguiente: DisCoVery GeneFinder™ WGene. Los dos métodos de extracción de RNA mostraron buenos y similares resultados; se seleccionó MagaBio plus Virus RNA Purification Kit II (BioFlux) 9-min debido a su rápido tiempo de procesamiento. El reactivo FlashPrep® mostró excelentes resultados para realizar detección directa de RNA. Los ensayos de amplificación isotérmica mostraron valores de sensibilidad y de especificidad aceptables (80%), excepto en muestras con Ct 30. Nuestros resultados muestran kits de RT-PCR en tiempo real óptimos, como así también métodos moleculares alternativos para el diagnóstico de SARS-CoV-2 que resultan aceptables para su uso en contextos adversos, de descentralización y en diferentes escenarios epidemiológicos, para la detección rápida y precisa del SARS-CoV-2.

2.
Rev. argent. microbiol ; 49(4): 323-327, Dec. 2017. ilus, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1041796

RESUMO

In Argentina, the epidemiological and molecular characteristics of Chlamydia psittaci infections are still not sufficiently known. A total of 846 respiratory and 10 ocular samples from patients with suspected human psittacosis were tested for C. psittaci from January 2010 to March 2015. Four samples of birds related to these patients were also studied. Forty-eight samples were positive for C. psittaci by a nested PCR. The molecular characterization of twelve C. psittaci PCR-positive samples received in the National Reference Laboratory INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán", Buenos Aires, Argentina was performed. Eight positive samples from humans and four from birds were genotyped by ompA gene sequencing. C. psittaci genotype A was found in all human samples and in the related birds. This report contributes to our increasing knowledge of the epidemiological and molecular characteristics of C. psittaci to conduct effective surveillance of its zoonotic infections.


En la Argentina, aún no se conocen suficientemente las características epidemiológicas y moleculares de las infecciones por Chlamydia psittaci. Entre enero del 2010 y marzo del 2015 se estudiaron 846 muestras respiratorias y 10 oculares de pacientes con sospecha de psitacosis para la búsqueda de C. psittaci. También se estudiaron 4 muestras de aves relacionadas con estos pacientes. De ese total, 48 muestras fueron positivas para C. psittaci mediante una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) anidada. Posteriormente, se realizó en el INEI-ANLIS «Dr. Carlos G. Malbrán¼ la caracterización molecular de 12 muestras positivas para C. psittaci, 8 de humanos y 4 de aves, que fueron genotipificadas por secuenciación del gen ompA. C. psittaci genotipo A se encontró en todas esas muestras. Este informe contribuye a mejorar nuestro conocimiento de las características epidemiológicas y moleculares de C. psittaci para lograr una vigilancia efectiva de la zoonosis que produce.


Assuntos
Animais , Humanos , Psitacose , Zoonoses , Chlamydophila psittaci , Psitacose/genética , Psitacose/epidemiologia , Argentina , Aves/microbiologia , Chlamydophila psittaci/isolamento & purificação , Chlamydophila psittaci/genética
3.
Actual. SIDA. infectol ; 89(23): 45-51, 20150000. tab, fig
Artigo em Espanhol | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1531926

RESUMO

ntroducción: Las infecciones zoonóticas son una creciente amenaza para la salud mundial. Varias especies de Chlamydia y sus implicancias son poco conocidas. Objetivo: Profundizar el conocimiento eco-epidemiológico de Chla-mydia en Córdoba.Materiales y métodos: Se implementaron técnicas serológicas y mo-leculares para la detección de Chlamydia en 314 individuos sanos, 44 con nexo epidemiológico asociado a Psitacosis, 505 aves silvestres, 288 aves cautivas, 30 reptiles y 30 equinos. Resultados: En humanos se detectó C. pneumoniae, C. pecorum, C. psittaci, y co-infecciones asociadas a mayor cuantificación bac-teriana. La prevalencia de anticuerpos en indivi-duos sanos fue de 14,3 % y en pacientes 68,2 %. Se evidenció una respuesta inmune exacerbada en trabajadores en contacto con reptiles infectados con C. pneumoniae. En aves cautivas se identificó C. pneumoniae, C. psittaci, C. pecorum, C. galliná-cea y co-infecciones con mayor concentración de ADN. Las aves silvestres no excretaban Chlamydia. En equinos se halló C. pneumoniae, también en Su-ricata suricatta y Atelerix albiventris. El genotipo A se halló en humanos, reptiles, aves, mamíferos no humanos y B en equinos. Conclusiones: C. psittaci genotipo WC se detectó en aves y humanos; en menor frecuencia los genotipos E/B y A. Este hallazgo sugiere que los animales pueden representar una fuente subestimada de C. psittaci. El hallazgo de C. pneumoniae y C. pecorum en pacientes y en animales, plantea posibles ciclos zoonóticos y la necesidad de diagnóstico diferencial. Estos resultados avalaron el decreto de ley provincial de tenencia y comercialización de animales, promovido por la Secretaría de Am-biente de Córdoba


Introduction: Zoonotic infections are a growing threat to global health. Chlamydia and its implications are not well known.The aim of this study was to further the eco-epidemiological knowledge of Chlamydia in Cordoba.Materials and methods: Serological and molecular techniques was implemented for detection of Chlamydia in 314 healthy individuals, 44 individuals associated with Psittacosis, 505 wild birds, 288 captive birds, 30 reptiles and 30 equine.Results: In humans were detected C. pneumoniae, C. pecorum, C. psittaci and co-infections associated with increased bacterial quantification.The prevalence of antibodies in healthy individuals was 14.3% and 68.2% patients. Exacerbated immune response was detected in workers with contact infected with C. pneumoniae evidenced reptiles.In captive birds we detected C. pneumoniae, C. psittaci, C. pecorum, C. gallinácea and co-infections with the highest concentration of DNA. Wild birds did not excrete Chlamydia.In horses we found C. pneumoniae, also in Suricata suricatta and Atelerix albiventris. The genotype was found in humans, reptiles, birds, mammals and non-human equine B.Conclusions: C. psittaci WC genotype was detected in birds and humans; less frequently genotypes E/B and A. This finding suggests that animals can be a source of C. psittaci underestimated.The discovery of C. pneumoniae and C. pecorum in patients and animals raises potential zoonotic cycles and the need for differential diagnosis.These results endorsed the decree of provincial law to possess and marketing of animals, promoted by Secretaría de Ambiente de Córdoba


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Infecções por Chlamydia/epidemiologia , Zoonoses/epidemiologia , Chlamydophila psittaci/imunologia , Prevalência , Chlamydophila pneumoniae/imunologia , Atenção à Saúde/organização & administração
4.
Rev. argent. microbiol ; 46(3): 256-268, oct. 2014.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1015103

RESUMO

Los microbicidas constituyen una nueva herramienta, todavía en proceso de investigación, que podrían ayudar en la prevención de la infección por los virus de la inmunodeficiencia humana (Human immunodeficiency virus: HIV) y de otras infecciones de transmisión sexual (ITS). Una serie de evidencias ha demostrado que la complejidad de la transmisión sexual de patógenos virales requiere de la identificación de compuestos capaces de bloquear los eventos tempranos del ciclo de infección viral. En este manuscrito hacemos una revisión exhaustiva de las diferentes estrategias que se han estudiado o se están considerando para prevenir ITS mediante el uso de microbicidas, haciendo particular énfasis en aquellos con el potencial de bloquear la infección por el HIV. También se revisa el proceso complejo de evaluación preclínica que se requiere para llegar a estudios en humanos y se concluye con un breve análisis de las estrategias que podrían formar parte del futuro inmediato en la investigación de microbicidas


Microbicides are a new tool, still under investigation, which could help prevent infection by the human immunodeficiency virus (HIV) and other sexually transmitted infections (STIs). Increasing evidence shows that the complexity of sexual transmission of viral pathogens requires the identification of compounds able to block the early events during the cycle of viral infection. In this manuscript we provide a comprehensive review of the different microbicide strategies that have been studied or are currently being considered for STI prevention, particularly emphasizing those having the potential to block HIV infection. The manuscript also reviews the complex process that is required to conduct future clinical studies in humans and concludes with a brief discussion of the strategies that could be part of the immediate future in microbicide research


Assuntos
Infecções Sexualmente Transmissíveis/prevenção & controle , Fármacos Anti-HIV/análise , Vacinas contra Papillomavirus/análise , Antivirais/uso terapêutico , Infecções Sexualmente Transmissíveis/diagnóstico , Infecções Sexualmente Transmissíveis/terapia , Herpesvirus Humano 2/efeitos dos fármacos , Anti-Infecciosos/uso terapêutico
5.
Rev. argent. microbiol ; 46(1): 45-48, mar. 2014.
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1009788

RESUMO

En la región central de Argentina, las características epidemiológicas y moleculares de las infecciones por Chlamydophila pneumoniae en reptiles son desconocidas. Para detectar C. pneumoniae, se usó la reacción en cadena de la polimerasa anidada que amplifica el gen rpoB en muestras de hisopado cloacal de 19 reptiles. Once (57,89 %) reptiles resultaron positivos. La secuenciación y el análisis filogenético corroboraron la presencia de esta bacteria. No se detectó ADN de C. pneumoniae en la faringe ni IgM anti-C. pneumoniae en el suero de los cuidadores; sin embargo, ellos presentaron títulos muy elevados de IgG anti-C. pneumoniae. La detección de ADN de C. pneumoniae en los reptiles demostró la circulación de este agente en el centro recreativo donde se realizó este estudio, lo que podría explicar la exacerbada respuesta inmunitaria en los cuidadores; este hallazgo sugiere la presencia de un potencial ciclo zoonótico. Se reporta aquí por primera vez la detección de C. pneumoniae en reptiles en Argentina


In the central area of Argentina, the epidemiological and molecular characteristics of Chlamydophila pneumoniae infections in reptiles are still unknown. A nested polymerase chain reaction of the rpoB gene was used to detect C. pneumoniae in cloacal swab samples from 19 reptiles at a recreational area. Eleven (57.89%) reptiles were positive; the sequencing and phylogenetic analysis confirmed the presence of this bacterium. Neither C. pneumoniae DNA in the caregivers'pharynges nor IgM antibodies anti-C. pneumoniae in their serum samples were detected; however, caregivers presented very high titers of IgG anti-C. pneumoniae. The detection of C. pneumoniae DNA in reptiles demonstrated the circulation of this agent in the recreational area and could be responsible for the exacerbated immune response of the personnel handling the reptiles, which suggests a potential zoonotic cycle. This is the first report of the detection of C. pneumoniae in reptiles in Argentina


Assuntos
Animais , Argentina/epidemiologia , Répteis/microbiologia , Infecções por Chlamydophila/diagnóstico , Filogenia , /métodos , Chlamydophila pneumoniae/isolamento & purificação
6.
Rev. argent. microbiol ; 44(2): 65-68, jun. 2012. ilus, graf, tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-657613

RESUMO

Bacteria belonging to the family Chlamydiaceae cause a broad spectrum of diseases in a wide range of hosts, Including humans, other mammals and birds. However, very little is known about chlamydial infections in birds in our region. In the present study, we examined 28 clinically normal birds In illegal captivity that were confiscated in the province of Córdoba, Argentina. The objective was to detect Chlamydophila spp. in cloacal swabs by genetic analysis of the ompA gene. Nested-PCR of the ompA gene identified five samples as Chlamydophila pecorum and the sequence analysis demonstrated the presence of the ompA gene of C. pecorum In these birds. On the other hand, Chlamydophila psittaci was not detected. These birds could be either asymptomatic reservoirs or subclinical carriers of C. pecorum. This is the first report of the detection of C. pecorum in Argentina.


Las bacterias que pertenecen a la familia Chlamydiaceae causan un extenso espectro de enfermedades en una amplia gama de huéspedes, incluidos los seres humanos, otros mamíferos y aves. Sin embargo, se sabe muy poco acerca de las infecciones por clamidias en aves de nuestra reglón. Esta Investigación examinó 28 aves clínicamente normales mantenidas en cautiverio ¡legal, que fueron confiscadas en Córdoba, Argentina. El objetivo fue detectar Chlamydophila spp. en hisopados cloacales por análisis del gen ompA. La PCR anidada del gen ompA reveló la presencia de Chlamydophila pecorum en cinco muestras. El análisis de secuencias demostró la presencia del gen ompA de C. pecorum en estas aves. Por el contrario, Chlamydophila psittaci no se detectó. Estas aves pueden ser reservónos asintomáticos o portadores subclínlcos de C. pecorum. Este es el primer informe de la detección de C. pecorum en la Argentina.


Assuntos
Animais , Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/genética , Portador Sadio/veterinária , Infecções por Chlamydophila/veterinária , Chlamydophila/genética , Genes Bacterianos , Passeriformes/genética , Sequência de Aminoácidos , Argentina/epidemiologia , Portador Sadio/epidemiologia , Portador Sadio/microbiologia , Infecções por Chlamydophila/epidemiologia , Infecções por Chlamydophila/microbiologia , Chlamydophila/classificação , Cloaca/microbiologia , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , Alinhamento de Sequência , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Especificidade da Espécie
7.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 107(1): 125-128, Feb. 2012. mapas, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-612815

RESUMO

Rio Negro virus (RNV) (Venezuelan equine encephalitis subtype VI) circulates only in Argentina; in northern provinces, isolates have been obtained from mosquitoes and rodents since 1980 and have been associated with acute febrile illness in humans. However, no studies of RNV have been performed in the central area of the country. We carried out molecular and serological detection of RNV in Córdoba, a province of the central part of the country, in mosquitoes and humans, respectively. One mosquito pool tested positive for alphavirus RNA by reverse transcriptase-nested polymerase chain reaction (RT-nested PCR). Subsequent sequencing determined that this alphavirus grouped with RNV. Serological studies detected antibodies to RNV in one human serum sample, which was obtained during the same period that RNV was detected using the aforementioned molecular methods. This is the first report of RNV circulation in the central area of Argentina, indicating an expansion of its original distribution. These results highlight the importance of strengthening surveillance procedures in endemic areas, as well as in new regions where RNV may emerge.


Assuntos
Adolescente , Adulto , Idoso , Idoso de 80 Anos ou mais , Animais , Criança , Pré-Escolar , Humanos , Lactente , Recém-Nascido , Pessoa de Meia-Idade , Adulto Jovem , Culicidae/virologia , Vírus da Encefalite Equina Venezuelana/genética , Encefalomielite Equina Venezuelana/virologia , Insetos Vetores/virologia , Anticorpos Antivirais/sangue , Argentina/epidemiologia , Vírus da Encefalite Equina Venezuelana/imunologia , Vírus da Encefalite Equina Venezuelana/isolamento & purificação , Encefalomielite Equina Venezuelana/diagnóstico , Encefalomielite Equina Venezuelana/epidemiologia , Reação em Cadeia da Polimerase , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , RNA Viral/análise
8.
Rev. salud pública (Córdoba) ; 13(2): 15-21, dez. 2009. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-542113

RESUMO

La presencia de RNA-HCV y la distribución de genotipos se detectaron mediante técnicas moleculares (RT-nested PCR y RFLP) en 310 muestras de individuos de la región centro de Argentina. Se halló 11,8% de coinfección HCV/HIV, con mayor prevalencia de genotipo 1 (73%). La distribución de los genotipos 1 y 2 entre individuos monoinfectados fue de 49,4% y 43,9%, respectivamente. El análisis de regresión logística multivariado mostró que la edad y el uso de drogas endovenosas (UDEV) condicionó la distribución de genotipos. El genotipo 2 se halló frecuentemente entre adultos mayores y su diseminación no se pudo asociar a ninguna vía de transmisión. El genotipo 1 se lo halló principalmente en adultos jóvenes y asociados al UDEV. El notable incremento de genotipo 1, homogéneamente distribuido en todas las edades posee importantes implicancias en las decisiones terapéuticas, considerando que posee baja respuesta a laterapia antiviral.


Assuntos
Epidemiologia Molecular , Hepatite C , Vírus de Hepatite
9.
Acta bioquím. clín. latinoam ; 42(1): 11-16, ene.-mar. 2008. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-633039

RESUMO

El objetivo de este estudio fue determinar la prevalencia de autoanticuerpos titulares y de factor reumatoideo (FR) en la infección crónica por Virus de la Hepatitis C (VHC) y su relación con el genotipo viral y tratamiento antiviral. Este estudio incluyó a 21 pacientes infectados con VHC y 24 sujetos sanos. Los autoanticuerpos: antinucleares (ANA), anti-músculo liso (ASMA), anti-mitocondriales (AMA) y anti-microsomales de hígado y riñón-1 (LKM-1) fueron investigados por inmunofluorescencia indirecta y el FR por aglutinación de látex. ANA fueron detectados en el 43% de pacientes y en el 4% de controles (p<0,05). ASMA, AMA Y LKM-1 no se detectaron en pacientes ni en controles. El FR estuvo presente en el 48% de los pacientes, pero en ninguno de los controles. En pacientes ANA (+) y/o FR (+), el nivel de la enzima alanina-aminotransferasa fue similar al nivel detectado en pacientes ANA y FR negativos. Además, la presencia de ANA o FR no estuvo asociada con el genotipo viral o tratamiento antiviral. En conclusión, una alta prevalencia de ANA y FR a títulos bajos pueden ser detectados en la infección crónica por VHC. Estas manifestaciones autoinmunes no están relacionadas con signos bioquímicos de daño hepático, ni genotipo viral o tratamiento antiviral.


The aim of this study was to determine the prevalence of tissue autoantibodies and rheumatoid factor (RF) in patients with chronic hepatitis C virus (HCV) infection and their relationship with viral genotype and antiviral treatment. This study included 21 patients infected with HCV and 24 healthy subjects. Anti-nuclear (ANA), anti-smooth muscle (SMA), anti-mitochondrial (AMA) and anti-liver-kidney microsomal-1 (LKM-1) autoantibodies were investigated by indirect immunofluorescence technique, and RF by latex agglutination. ANA were found in 43% of the patients with HCV infection and 4% of the controls (p<0.05). SMA, AMA and LKM-1 were absent from both groups (patients and controls). RF was detected in 48% of the patients but none of the controls. The level of serum alanine aminotransferasa enzyme was similar in all the patients' positive or negative results for ANA and/ or RF. Furthermore, the presence of ANA or RF was not associated with viral genotype or antiviral treatment. In conclusion, a high prevalence of ANA and RF at low titre can be detected in patients with HCV chronic infection. These autoimmune manifestations are not related with biochemical findings of hepatic injury, nor with genotype or antiviral treatment.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Idoso , Hepacivirus/imunologia , Anticorpos Anti-Hepatite C/imunologia , Fator Reumatoide/imunologia , Hepacivirus/genética , Genótipo
10.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 102(8): 995-998, Dec. 2007. ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-471852

RESUMO

In Argentina, most information on hepatitis C virus (HCV) genotype distribution comes from studies carried out in Buenos Aires (east province). In order to identify HCV subtypes in central Argentina, nucleotide sequencing of core region was performed in samples from 36 patients living in Córdoba, the second most populated province of Argentina. The sequence analysis identified subtype 2c as the most prevalent (50 percent), followed by subtype 1b (33 percent) and to a lesser extent by subtypes 1a (11 percent), 3a (3 percent) and 4a (3 percent). This is the first report of circulation of HCV subtype 2c in this region of Argentina and also such high prevalence has never been found before in the genotype distribution of South America.


Assuntos
Adulto , Idoso , Feminino , Humanos , Masculino , Pessoa de Meia-Idade , Hepacivirus/genética , Anticorpos Anti-Hepatite C/sangue , Hepatite C/virologia , /genética , Argentina/epidemiologia , Sequência de Bases , Genótipo , Hepacivirus/isolamento & purificação , Hepatite C/epidemiologia , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , Reação em Cadeia da Polimerase , Polimorfismo de Fragmento de Restrição , Prevalência , RNA Viral/sangue , População Urbana
11.
Córdoba; s.n; 2006. 209 p. ilus.
Tese em Espanhol | LILACS | ID: lil-436223

RESUMO

El virus de hepatitis C (HCV) es una de las principales causas de enfermedad hepática crónica. La coinfección con HIV acelera la progresión de la enfermedad causada por HCV, incrementa la transmision de HCV y parece empeorar la infección por HIV. Los genetipos de HCV tienen incidencia sobre la clínica, histología y respuesta del tratamiento antiviral y han sido asociados con áreas geográficas y modos especificos de transmisión. El objetivo del presente estudio fue determinar el perfil molecular de HCV en Córdoba, Argentina. Para la detección de ARN del HCV se implementó una RT-nested PCR de la región 5`no codificante (5' NC) y la genotipificación se realizó medicante restricción enzimática y análisis de los fragments largos de restricción de la misma región genómica. Entre los individuos infectados con HCV, HIV negativos (N=149) hallamos una alta prevalencia de HCV genotipo 2 (49


Assuntos
Hepacivirus , Hepatite C , Argentina
12.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 100(3): 303-307, May 2005. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-411029

RESUMO

This study was conducted to compare among the most recent generation of five screening tests licensed in Argentina, in order to evaluate which of the tests has the best sensitivity for detection of antibodies against hepatitis C virus (HCV). The tests analyzed were: Detect-HCV™ (3.0) Biochem ImmunoSystems, Canada; Hepatitis C EIA Wiener Lab., Argentina; Equipar HCV Ab, Italy; Murex HCV 4.0, UK and Serodia-HCV particles agglutination test, Japan. The results obtained showed high discrepancy between the different kits used and show that some of the tests assessed have a low sensitivity for anti-HCV detection in both chronic infections and early seroconversion, and indicate that among the commercially available kits in Argentina, Murex HCV 4.0 (UK) and Serodia-HCV particles agglutination test (Japan) have the best sensitivity for HCV screening. Although the sensitivity of the assays is the first parameter to be considered for blood screening, more studies should be carried out to assess the specificity of such assays.


Assuntos
Humanos , Hepacivirus/imunologia , Anticorpos Anti-Hepatite C/sangue , Hepatite C/diagnóstico , Kit de Reagentes para Diagnóstico/normas , Argentina , Anticorpos Anti-Hepatite C/imunologia , Sensibilidade e Especificidade
13.
Medicina (B.Aires) ; 63(3): 205-210, 2003. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-343167

RESUMO

To determine hepatitis C virus (HCV) genotypes circulating in the central region of Argentina, 96consecutive anti-HCV positive subjects were studied. The presence of HCV RNA was detected in 60samples by RT-nested PCR of the 5Æ noncoding region (5Æ NCR). Genotyping was performed by restriction fragmentlength polymorphism analysis of 5Æ NCR region combined with PCR using type-specific primers of the core region.The groups of individuals in this study included hemophilia and hemodialysis patients, injecting drug users, screened blood donors, and patients with acute or chronic liver disease, all from Córdoba, Argentina. Overall, genotype 2 was the most prevalent (55.0%), followed by genotypes 1 (38.3 %), and 3 (5.0%). Within genotype 1, subtype 1b was the most prevalent. An unexpected high prevalence of genotype 2 (61.9%) was found among patients with acute or chronic HCV infection (without known risk factors). These figures differ from other cohorts from East-Argentina where genotype 1 has been found as the most prevalent. This indicates that regional differences of genotype distribution might exist between Central and East Argentina.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adolescente , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Hepacivirus , Hepatite C , Anticorpos Anti-Hepatite C , Argentina , DNA Viral , Genótipo , Hepacivirus , Hepatite C , Reação em Cadeia da Polimerase , Polimorfismo de Fragmento de Restrição , Prevalência
14.
Rev. Inst. Med. Trop. Säo Paulo ; 44(2): 59-62, Mar.-Apr. 2002. ilus, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-308007

RESUMO

A serological screening was performed in 615 individuals aged 0-87 years, living in the city of Cordoba, Argentina to study the relationship between antibody prevalence for the SLE virus and age. A 13.98 percent prevalence of neutralizing antibodies was obtained and its relation to age was significantly high (p = 0.045). The highest seroprevalence was noted on individuals over 60 years old (>20 percent), whereas no subject under 10 was seropositive for this virus. Our results confirm that the agent is endemic in this area and neurological pathology studies should be performed on those individuals aged 60 since they represent the most susceptible group to SLE virus


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Recém-Nascido , Lactente , Pré-Escolar , Criança , Adolescente , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Anticorpos Antivirais , Vírus da Encefalite de St. Louis , Encefalite de St. Louis , Fatores Etários , Idoso de 80 Anos ou mais , Argentina , Modelos Logísticos , Programas de Rastreamento , Testes de Neutralização , Prevalência , Estudos Soroepidemiológicos
15.
Rev. Inst. Med. Trop. Säo Paulo ; 43(6): 339-340, Nov.-Dec. 2001. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-303045

RESUMO

An in house indirect immmunofluorescence assay ( IFA ) in relation to neutralization (NT) reference test, was assessed as a fast and cheap method to carry out serological surveys for St. Louis Encephalitis virus (SLE). Sera obtained from 213 blood donors were analyzed by both tests. The prevalence of seropositivity obtained with IFA was lower than (30.98 percent) that observed on NT (41.78 percent). The relative specificity rate of IFA was 96.77 percent whereas its relative sensitivity rate was 69.66 percent. Kappa index showed a good correlation between both tests. The results indicate that neutralization assay is still the serological test with the highest sensitivity and specificity relative rates for detecting antibodies against SLE virus. Nevertheless, the IFA could be useful as an alternative test in order to learn the circulation of the Flavivirus genus in a certain area


Assuntos
Humanos , Anticorpos Antivirais , Vírus da Encefalite de St. Louis , Anticorpos Antivirais , Técnica Indireta de Fluorescência para Anticorpo , Testes de Neutralização , Sensibilidade e Especificidade
16.
Medicina (B.Aires) ; 60(4): 474-6, 2000. tab, graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-273472

RESUMO

El objetivo del presente trabajo fue conocer la prevalencia de anticuerpos para el virus encefalitis San Luis (ESL) en sueros humanos del Laboratorio de Vigilancia Epidemiológica del departamento Formosa (provincia de Formosa, Argentina), extraídos en los años 1995 y 1997, se emplearon las pruebas de inhibición de la hemaglutinación (IH) y de neutralización (NT). El tamizaje realizado mediante la prueba de NT mostró una prevalencia del 21 por ciento (60/284) y 32 por ciento (50/157) en las muestras obtenidas en los años 1995 y 1997 respectivamente. El 14 por ciento de los sueros del año 1995 presentaron títulos de anticuerpos neutralizantes (NT) bajos (1/20 y 1/40) mientras que en el año 1997 el 19 por ciento de los sueros tenían títulos de anticuerpos NT iguales o mayores a 1/80. En la titulación simultánea de anticuerpos por NT e IH se observaron sueros con títulos bajos de anticuerpos NT (1/20-1/40) y negativos en IH, mientras que otros poseían títulos altos por ambas pruebas. Esta relación entre los títulos de anticuerpos indica la presencia de infecciones pasadas y recientes y la circulación continua de este virus. Por otra parte la prevalencia de anticuerpos NT en la población estudiada se incrementó significativamente en 2 años (p < 0.0075), lo que confirma la endemicidad de este agente en la zona y muestra la necesidad de realizar estudios de las enfermedades febriles de etiología viral no confirmadas, a fin de conocer su importancia como patógeno humano en nuestro país.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Criança , Adolescente , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Anticorpos Antivirais/isolamento & purificação , Vírus da Encefalite de St. Louis/imunologia , Encefalite de St. Louis/epidemiologia , Argentina/epidemiologia , Líquido Ascítico , Encefalite de St. Louis/sangue , Testes de Hemaglutinação/métodos , Testes de Neutralização/métodos , Prevalência , Estudos Soroepidemiológicos
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